Batou está decidido a probar la inocencia del coronel Soga. Este se comunica en secreto con él para organizar una operación y robar Pandora, una base de datos que incluye información sobre operaciones y secretos militares.Para abrir la base de datos y que la verdad salga a la luz, necesitan un módulo militar y una gran capacidad de procesamiento que consiguen interviniendo el control de tráfico de la ciudad, pero en plena operación alguien se hace con el código del módulo. Para complicar aún más la situación, Aramaki le ordena a Kusanagi que investigue la relación entre la sincronización de un Logicoma y la intervención. ¿Cuál será el desenlace de esta enmarañada trama?
